Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms