Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TARSL2A2RTX5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms