Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms