Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA3Q9Y6H8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms