Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP16Q9Y5T5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms