Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms