Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHDC2Q9Y2U9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms