Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAN1Q9Y2M0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms