Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF5Q9Y2D1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms