Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms