Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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