Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms