Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TDP1Q9NUW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TDP1Q9NUW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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