Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCF3Q9NUQ8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms