Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms