Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms