Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB3Q9NQW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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