Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms