Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX1Q9NP08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX1Q9NP08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms