Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L4AQ9HCS5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms