Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC44

GPBP1L1, Vasculin-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1L1Q9HC44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1L1Q9HC44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBP1L1Q9HC44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms