Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3GQ9HC16 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms