Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLSPNQ9HAW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms