Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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