Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF541Q9H0D2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF541Q9H0D2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms