Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDGFDQ9GZP0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms