Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF3BQ9BZI7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF3BQ9BZI7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms