Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHANK3Q9BYB0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHANK3Q9BYB0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms