Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYCP2Q9BX26 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms