Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms