Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms