Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms