Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTKNQ9BST9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms