Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMCHL2Q9BQD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PMCHL2Q9BQD1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms