Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD5Q99666 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms