Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRBPQ96SI9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRBPQ96SI9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms