Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85AQ96PX6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms