Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
YTHDC1Q96MU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
YTHDC1Q96MU7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms