Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms