Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD4Q96M96 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD4Q96M96 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms