Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227BQ96M60 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms