Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms