Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD4Q96DM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms