Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP4CQ96CF2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms