Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC127Q96BQ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC127Q96BQ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms