Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms