Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms