Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO1Q92973 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms