Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD50Q92878 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms