Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPGRQ92834 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRQ92834 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms